2. en と le, la, les の使い分け

関係ないのです。en は名詞の性・数に関係なく使うことができます。それで，「中性代名詞」と呼ばれることもあります。名詞の性・数に応じて使い分けなければならない le, la, les とこの点も違っていますね。また，en は中性だから，過去分詞の前に置かれても，過去分詞は一致しません。

　J'ai visité la tour Eiffel il y a deux ans.
　→× Je l’ai visité il y a deux ans.
　　○ Je l’ai visitée il y a deux ans.

　J'ai acheté des carottes.
　→ ○ J' en ai acheté.
　　 × J' en ai achetées.